جداسازی و توالی یابی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری ها (rgas)در ارقام زراعی و خویشاوندان وحشی جو

thesis
abstract

تولید ارقام مقاوم به بیماری ها، یکی از روش های زیست محیطی برای تولید پایدار و کنترل بیماری های گیاهی است. لازمه این کار شناسایی ژن های مقاومت و انتقال آن به ژنوتیپ -های مطلوب می باشد. به منظور جداسازی و توالی یابی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری در جو، از 11 ترکیب آغازگرهای دژنره در شش رقم زراعی دایتون رانی، ماکویی، آبیدر، قره آرپا، سهند1 و urb81-3 و سه گونه وحشی hordeum marinum، h. spontaneum و h. bulbosum استفاده شد که شش ترکیب آغازگر قطعاتی را در ژنوتیپ های مورد مطالعه تکثیر کردند. از قطعات تکثیری هر ترکیب، سه تا چهار نوار از ژل جداسازی و پس از تکثیر، توالی-یابی شدند. توالی قطعات متناظر همردیف شده و تنوع نوکلئوتیدی و شباهت بین توالی ها محاسبه گردید. بیشترین شباهت بین ارقام زراعی در قطعات تکثیر شده توسط جفت آغازگر cre3gene536-556/cre3gene1040-1060 مشاهده شد. در تعدادی از قطعات تکثیری نیز ارقام زراعی شباهت نسبتاً بالایی با گونه های وحشی نشان دادند. نسبت جایگزینی ناهمنام به همنام در مقایسه دو به دوی توالی اسیدآمینه ای رمز شده توسط قطعات برای برخی مقایسه ها بزرگتر از یک و در تعدادی کوچکتر از یک بود. حذف و اضافه شدگی هیچ کدام از قطعات تکثیر شده معنی دار نبود. تعدادی از توالی ها دارای چارچوب قرائت آزاد بودند. همردیفی توالی قطعات تکثیری با توالی های موجود در داده پایگاه ncbi نشان دهنده شباهت بالای توالی برخی از قطعات با ژن های مقاومت شناخته شده و rgaها بود. به عنوان مثال، قطعات تکثیری توسط جفت آغازگر cre3gene536-556/cre3gene1040-1060 با ژن های مقاومت به زنگ ساقه rpg4 و rpg5، ژن مقاومت rym4 و ژن مقاومت به سفیدک سطحی mla در جو و rga1 و rga2 گندم شباهت بالایی نشان دادند. همچنین قطعات تکثیری توسط جفت آغازگرh2016/h1146 با ژن های مقاومت lr34 گندم و ژن مقاومت rpg1-b سویا شباهت داشت. قطعه شماره 3 تکثیری توسط جفت آغازگر h2016/h2020 در رقم سهند1 با ژن yr36 در گندم وحشی emmer و قطعات تکثیری توسط جفت آغازگر h2016/h2022 با ژن مقاومت به زنگ ساقه جو (rpg1) شباهت نشان داد. تعدادی از قطعات تکثیری توسط جفت آغازگر h2016/h2027 با ژن های مقاومت lr1، lr34، rpg4 و rpg5 شباهت بالایی داشتند.

First 15 pages

Signup for downloading 15 first pages

Already have an account?login

similar resources

جداسازی ، همسانه‌سازی، توالی یابی و بررسی بیوانفوماتیکی آنالوگ ژن مقاومت به ویروس موزائیک گوجه فرنگی در طالبی بومی رقم TN-92-99

جنس Cucurbita از خانواده کدوئیان (Cucurbitacea) می‌باشد. این گیاهان، مورد حمله طیف وسیعی از عوامل بیماری‌زا قرار می‌گیرند. در حال حاضر تدبیر کارآمد برای کنترل بسیاری از بیماری‌های کدوئیان، استفاده از گیاهان مقاوم می‌باشد. در این مطالعه قلمرو NBS کد شونده با ژن‌های مقاومت در ارقام طالبی بومی ایران بررسی شد. به این منظور بذور ارقام مختلف طالبی ایرانی تهیه و در گلخانه کشت داده شدند. استخراج DNA به...

full text

جداسازی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری(rgas) در سیب زمینی با استفاده از روش

استفاده از ارقام مقاوم یکی از راه کارهای اصلی کاهش خسارت ناشی از تنش های زیستی در گیاهان است. لازمه تولید چنین ارقامی شناسایی، جداسازی و مکان یابی ژن های مقاومت به بیماری است. در این پژوهش، برای جداسازی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری در سیب زمینی از روش motif directed profiling (mdp) استفاده شد. بدین منظور، هفت آغازگر دژنره طراحی شده براساس دامنه حفاظت شده tir ژن های مقاومت به بیماری گیاهی ...

full text

شناسایی روابط فیلوژنتیکی گندم های زراعی و اجداد آن بر اساس توالی یابی ژن (HKT)

شوری یکی از مشکلات مهم در اراضی کشاورزی دنیا می‌باشد، به طوری که سالانه میلیون‌ها تن نمک از طریق آبیاری وارد خاک‌های زراعی می‌شود. گندم اولین و مهمترین گیاه زراعی دنیا است که غذای اصلی بیش از یک سوم مردم جهان را تأمین می‌کند. روش های نوین ژنتیکی همچون توالی‌یابی امکان ارزیابی دقیق و سریع مواد ژنتیکی در سطح DNA و RNA را فراهم نموده است. لذا به منظور شناسایی تنوع آللی ژن HKT از گونه‌های زراعی و و...

full text

مقایسه تأثیر وضعیت طاق باز و دمر بر وضعیت تنفسی نوزادان نارس مبتلا به سندرم دیسترس تنفسی حاد تحت درمان با پروتکل Insure

کچ ی هد پ ی ش مز ی هن ه و فد : ساسا د مردنس رد نامرد ي سفنت سرتس ي ظنت نادازون داح ي سکا لدابت م ي و نژ د ي سکا ي د هدوب نبرک تسا طسوت هک کبس اـه ي ناـمرد ي فلتخم ي هلمجزا لکتورپ INSURE ماجنا م ي دوش ا اذل . ي هعلاطم ن فدهاب اقم ي هس عضو ي ت اه ي ندب ي عضو رب رمد و زاب قاط ي سفنت ت ي هـب لاتـبم سراـن نادازون ردنس د م ي سفنت سرتس ي لکتورپ اب نامرد تحت داح INSURE ماجنا درگ ...

full text

بررسی کارکردی ژن های کاندید مقاومت به خشکی در گندم نان و برخی خویشاوندان وحشی آن

چکیده تنش خشکی مانع از تظاهر کامل پتانسیل ژنتیکی گیاهان زراعی می شود و از این رو موجب کاهش تولیدات کشاورزی می گردد. کمبود آب می تواند باعث القای ژن ها و تغییر الگوی بیان ژن در گیاه گردد. روش آنالیز expressed sequence tag (est) راهی سریع و منطقی برای کاندید کردن ژن های جدید برای مقاومت به تنش ها می باشد. در این تحقیق تعداد 12 کتابخانه est شاهد و تنش خشکی گندم و خویشاوندان وحشی آن شامل 37138 توا...

جداسازی و تعیین توالی ژن مقاومت به جیوه در باکتری رائولتلا پلانتی کولا

سابقه و هدف: جیوه یکی از منابع آلوده کننده محیط زیست، گیاهان و انسان می باشد. میکروارگانیسم ها با مکانیسم های مختلف نسبت به جیوه مقاومند که اصلی ترین این مکانیسم ها احیای جیوه سمی به جیوه عنصری می باشد. این توانمندی با واسطه ژن های مختلف در باکتری ها می باشد. هدف از این تحقیق بررسی وجود ژن مقاومت به جیوه در باکتری رائولتلا پلانتی کولا از طریق واکنش زنجیره ای پلی مراز و...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


document type: thesis

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تبریز - دانشکده کشاورزی

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023